Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CBX8Q9HC52 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CBX8Q9HC52 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBX8Q9HC52 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms