Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LY9Q9HBG7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms