Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPCSQ9HAB8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPCSQ9HAB8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPCSQ9HAB8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPCSQ9HAB8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPCSQ9HAB8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPCSQ9HAB8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPCSQ9HAB8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPCSQ9HAB8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPCSQ9HAB8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms