Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHEJ1Q9H9Q4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHEJ1Q9H9Q4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms