Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6K4

OPA3, Optic atrophy 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA3Q9H6K4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPA3Q9H6K4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPA3Q9H6K4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms