Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC86Q9H6F5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC86Q9H6F5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms