Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF3Q9H4W6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF3Q9H4W6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms