Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms