Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MFSD1Q9H3U5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD1Q9H3U5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms