Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6BQ9H3T3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA6BQ9H3T3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms