Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3P7

ACBD3, Golgi resident protein GCP60, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD3Q9H3P7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACBD3Q9H3P7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACBD3Q9H3P7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACBD3Q9H3P7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACBD3Q9H3P7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACBD3Q9H3P7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACBD3Q9H3P7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACBD3Q9H3P7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACBD3Q9H3P7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACBD3Q9H3P7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACBD3Q9H3P7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACBD3Q9H3P7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACBD3Q9H3P7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACBD3Q9H3P7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACBD3Q9H3P7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACBD3Q9H3P7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACBD3Q9H3P7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACBD3Q9H3P7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACBD3Q9H3P7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACBD3Q9H3P7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ACBD3Q9H3P7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACBD3Q9H3P7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162 ms