Protein–RNA interactions for Protein: Q9H175

CSRNP2, Cysteine/serine-rich nuclear protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2Q9H175 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP2Q9H175 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP2Q9H175 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP2Q9H175 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP2Q9H175 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP2Q9H175 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP2Q9H175 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP2Q9H175 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP2Q9H175 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP2Q9H175 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP2Q9H175 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP2Q9H175 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSRNP2Q9H175 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSRNP2Q9H175 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSRNP2Q9H175 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSRNP2Q9H175 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSRNP2Q9H175 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP2Q9H175 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRNP2Q9H175 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRNP2Q9H175 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRNP2Q9H175 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRNP2Q9H175 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRNP2Q9H175 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRNP2Q9H175 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRNP2Q9H175 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms