Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG10Q9H0Y0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG10Q9H0Y0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG10Q9H0Y0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG10Q9H0Y0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG10Q9H0Y0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG10Q9H0Y0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG10Q9H0Y0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms