Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC113Q9H0I3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC113Q9H0I3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms