Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F5

RNF38, E3 ubiquitin-protein ligase RNF38, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF38Q9H0F5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF38Q9H0F5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF38Q9H0F5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms