Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCL11BQ9C0K0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCL11BQ9C0K0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCL11BQ9C0K0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
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