Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC2Q9C0B9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms