Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM6Q9C030 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms