Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXP3Q9BZS1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXP3Q9BZS1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms