Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTPBP4Q9BZE4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTPBP4Q9BZE4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms