Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCGF6Q9BYE7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PCGF6Q9BYE7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms