Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL4Q9BYD3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL4Q9BYD3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms