Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms