Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms