Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL25A1Q9BXS0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL25A1Q9BXS0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL25A1Q9BXS0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms