Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUSC1Q9BVN2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUSC1Q9BVN2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUSC1Q9BVN2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUSC1Q9BVN2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms