Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP58Q9BVL2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms