Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM62Q9BVG3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM62Q9BVG3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms