Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CHCHD7Q9BUK0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHCHD7Q9BUK0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHCHD7Q9BUK0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHCHD7Q9BUK0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHCHD7Q9BUK0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHCHD7Q9BUK0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHCHD7Q9BUK0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHCHD7Q9BUK0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHCHD7Q9BUK0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.1 ms