Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUH8

BEGAIN, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEGAINQ9BUH8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BEGAINQ9BUH8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEGAINQ9BUH8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms