Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
H2AFJQ9BTM1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
H2AFJQ9BTM1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFJQ9BTM1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFJQ9BTM1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFJQ9BTM1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFJQ9BTM1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFJQ9BTM1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFJQ9BTM1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFJQ9BTM1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFJQ9BTM1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFJQ9BTM1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFJQ9BTM1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFJQ9BTM1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFJQ9BTM1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFJQ9BTM1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFJQ9BTM1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFJQ9BTM1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFJQ9BTM1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms