Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAGR1Q9BTK6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms