Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRACR2AQ9BSW2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRACR2AQ9BSW2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms