Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP6Q9BRS8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms