Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGIP1Q9BQI5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGIP1Q9BQI5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms