Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DUSP9Q99956 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUSP9Q99956 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms