Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOTCH4Q99466 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms