Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPK1Q96SB4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK1Q96SB4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms