Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIGSQ96S52 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIGSQ96S52 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms