Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms