Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNDC3BQ96NL0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms