Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSMCE3Q96MG7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE3Q96MG7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms