Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC7Q96M83 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms