Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF4Q96M43 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF4Q96M43 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms