Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EP400Q96L91 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EP400Q96L91 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms