Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00208Q96KT6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00208Q96KT6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms