Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPGRIP1Q96KN7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms