Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP47Q96K76 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP47Q96K76 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP47Q96K76 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP47Q96K76 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP47Q96K76 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP47Q96K76 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP47Q96K76 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP47Q96K76 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP47Q96K76 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP47Q96K76 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP47Q96K76 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP47Q96K76 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP47Q96K76 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP47Q96K76 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
USP47Q96K76 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP47Q96K76 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP47Q96K76 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP47Q96K76 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP47Q96K76 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
USP47Q96K76 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
USP47Q96K76 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms