Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC45A3Q96JT2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC45A3Q96JT2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms