Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC12Q96J65 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms