Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED3Q96IU2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
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